Sanat koleksiyoncusu, Kutsal Kâse’yi bulmak için Indiana Jones’a başvurur. Değerli kâsenin izini sürerken, kayıp bir arkeolog olduğunu keşfeder. Bu arkeologun kim olduğunu öğrenince şaşkına döner; kayıp arkeolog, Indiana Jones’un kendi babası olan Dr. Henry Jones’dur. Kutsal Kâse, efsanelere göre kalbi temiz olan kişilere büyük güçler sağlayan bir artefakttır. Ancak bulması zor ve tehlikeli bir görevdir. Kutsal Kâse’nin sırlarını çözmek için Indiana Jones ve babası, bir dizi zorlu macera ve tuzaklarla dolu bir yolculuğa çıkarlar. Naziler de Kutsal Kâse’nin peşindedirler ve onu kötü amaçları için kullanmak istemektedirler.